Відділ селекції та інноваційних технологій хмелю співпрацює:

з НМЦ «Інститут землеробства» НААН: проводяться спільні дослідження з розробки  агротехнологій вирощування органічного хмелю на Поліссі;

з Інститутом захисту рослин: проводяться дослідження з удосконалення системи захисту хмелю від шкідників та хвороб. Відділ є співвиконавцем ПНД 24 НААН «Захист рослин»;

з Інститутом сільськогосподарської мікробіології та агропромислового виробництва НААН: проводяться дослідження в біотехнології хмелю та інших технічних культур;

з Українським інститутом експертизи сортів рослин (м. Київ): на основі угоди про наукову співпрацю здійснюється післяреєстраційне вивчення сортів хмелю звичайного;

з Поліським Національним університетом (кафедра захисту рослин агрономічного факультету): на основі угоди проводяться спільні дослідження з визначення стійкості рослин хмелю до ураження патогенними організмами для розробки елементів біологічної системи захисту хмелю;

з Асоціацією хмелярів України: моніторинг стану галузі хмелярства, удосконалення нормативної та законодавчої бази для хмелярства;

з Головним управлінням Держпродспоживслужби в Житомирській області: моніторинг стану сільськогосподарських угідь на предмет розповсюдження шкідників та хвороб, формування фітосанітарних прогнозів та рекомендацій для контролю чисельності шкідників та хвороб на хмільниках;

з   підприємствами різних форм власності: за угодами здійснюються реєстраційні випробування нових препаратів на хмелю з урахуванням технології вирощування культури.